MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288 plasmid pSTU288-2

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021156	TTC	2	6	2	7	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021156	TGCC	2	8	35	42	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021156	GCCA	2	8	56	63	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021156	C	6	6	116	121	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5	NC_021156	CAG	2	6	178	183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021156	ATCC	2	8	212	219	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021156	AAT	2	6	233	238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021156	GCT	2	6	273	278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021156	AC	3	6	339	344	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021156	GCG	2	6	849	854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021156	AAAAGC	2	12	970	981	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_021156	CTGC	2	8	3614	3621	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_021156	AGG	2	6	3624	3629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021156	C	8	8	5314	5321	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15	NC_021156	ATT	4	12	5597	5608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021156	TCA	2	6	6471	6476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021156	GCC	2	6	8272	8277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_021156	GCG	2	6	8284	8289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021156	GCA	2	6	8383	8388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021156	ATCT	2	8	8496	8503	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021156	CCT	2	6	8841	8846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_021156	TCG	2	6	8908	8913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021156	GCG	2	6	8939	8944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021156	GCC	2	6	8967	8972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_021156	CTC	2	6	9003	9008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_021156	TCA	2	6	9041	9046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021156	GAAGC	2	10	9089	9098	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_021156	GC	4	8	9152	9159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021156	AGC	2	6	9174	9179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021156	GCCT	2	8	9180	9187	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_021156	GTC	3	9	9224	9232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021156	AGC	2	6	9291	9296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021156	GCT	2	6	9331	9336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021156	GTC	2	6	9366	9371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021156	GGC	2	6	9407	9412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.